地下仓库里躺着一具勒死的尸体，九名幸存者站在门外。水正从地下三层不断上涨，手机没有信号。他们相信，只有留下一个人送死，其余人才有机会逃生。于是，查出凶手成了挑选牺牲者的办法。他们只剩约 1 星期。
事情始于大学登山社团旧友的聚会。西村裕哉带众人参观半年前发现的地下建筑，却因地图标记偏移而迷路。越过山谷木桥时已经 16:48，天色渐暗，手机也早已失去信号，七人只得在那里过夜。同行者有越野柊一、野内さやか、高津花、絲山隆平、隆平的妻子絲山麻衣。柊一还请来了表兄篠田翔太郎。
荒草间的井盖下是一条竖井，向下 7-8 米便是通道。众人绕过缠着粗链的巨石，穿过铁门，进入名为“方舟”的三层地下建筑。翔太郎指导裕哉启动 107 号机械室的发电机，照明恢复。普通房门都与墙壁留有不规则缝隙。二层一侧走廊灯已损坏，209 号还存着疑似刑具。西端狭窄小室内有卷扬机，链条通向上方巨石。小室另有通往三层的阶梯，但三层已经积水。机械室图纸显示，西侧入口通往一层，东侧紧急出口通往三层，两处地盖相距约 100 米。两台监视器边框分别写着“出入口”、“非常口”，映出的都是荒草与井盖。此时天已全黑，地景看不清楚。裕哉曾从紧急出口下去，见到水便返回。裕哉翻图纸时，把抽屉里的指甲剪等杂物拿到桌上。麻衣和隆平后来留在机械室，看过这些物件。さやか忙着拍摄房间。她与裕哉、花外出找信号，回来时带上了另外三个人。
新来的人是矢崎幸太郎、妻子弘子、15 岁的儿子隼斗，自称采蘑菇时迷了路。幸太郎是本地电工。大家分出食品和寝具，十人暂时住在方舟。晚饭后，众人谈起最怕的死法，麻衣选了溺死。他们仍以为天亮便能离开。柊一与翔太郎同住 112 号。麻衣通过学生时代留下的对讲机应用联系柊一。这种应用不必联网，也能让附近的手机直接通话。柊一向表兄解释，麻衣曾长期向自己抱怨丈夫，隆平得知后颇有敌意。他担心重聚时发生冲突，才请翔太郎同行。熄灯后，走廊光线从门缝透进来，在房门四周勾出完整的长方形。
清晨，地震震倒钢架，传来巨响。众人发现，入口铁门被巨石堵住，十人都困在地下。二层卷扬机室的木板天花被石头压破，细钢梁已经弯曲。幸太郎提出拆梁落石，翔太郎却指出，石头还夹在一层壁面与通道地面之间，必须再用卷扬机向下拉。石头落入二层后，会堵死小室狭窄的门口，操作者只能留在里面。那里虽有通往三层的阶梯，三层却早已被水淹没。裕哉建议先找拆梁需要的六角扳手，也寻找其他移石工具。众人暂时搁置选人问题。柊一和翔太郎在 205 号找到装着封箱胶带、塑料胶带的纸箱，之后分开搜索。
6:13，柊一查看监控。按边框标记，“出入口”附近只有少量落石，“非常口”却被泥土、巨岩、倒木完全压住。隆平召集众人，确认三层水位正在上涨，惊慌中把手机掉进水里。隆平捞起手机，擦干后仍可使用。众人看过监控，推断木桥和山路也可能毁坏。即使先逃出去，救援恐怕也赶不上上涨的水，留下操作者便等于让他溺死。此时才有人发现，裕哉一直不见踪影。大家在一层 120 号找到裕哉。他被绳索勒死，绳结牢牢系在颈后。遇害时间只能是分头找扳手期间，人人都有独自行动的空隙。这个时机尤其矛盾。若要报复裕哉带错路，大可以让他成为留下的人。如今少了一个抽签者，凶手自己被选中的风险反而增加。翔太郎提醒，也许杀人者恰恰比别人更早知道处境。翔太郎估计，不足 1 星期后二层水深将达 1 米，卷扬机难以操作，燃料也将在相近时间耗尽。众人达成共识，先找凶手，再让此人留下。看到刑具，人人都想到了怎样强迫凶手服从，却没有明说。矢崎一家也曾分开行动，不能靠彼此的说法证明无罪。
幸太郎处理二层插座线路，防止水淹漏电。柊一和翔太郎拿来 205 号的胶带，却没用上，因为さやか已从 215 号找来深蓝色电工箱，里面有绝缘胶带。矢崎一家用完后把箱子放回原处。搬运物资时，众人还找到唯一一件涉水连体裤，以及两套潜水器材。两只 10 升气瓶各剩约 1/3 空气，却缺少背具和配重。既然紧急出口已被埋，大家认为这些东西没有逃生价值，把它们留在二层。众人逐件检查裕哉遗物，其中有透明拉链小袋，装着棉棒、指甲剪等小物。翔太郎收起背包，将薯片放进公共食品堆。翔太郎复查现场，仍无物证，强调不能凭动机故事认凶。花质疑矢崎一家为何会迷路到这里。幸太郎拒绝带家人与众人一起吃饭。隆平因隼斗取公共堆里的薯片而大骂他。麻衣责怪丈夫破坏合作，夫妻争吵又牵出她与柊一的联系。她搬到 116 号独住，柊一帮她搬好寝具，发觉自己越来越挂念她。
第二天中午，さやか组织和解饭局。谈到来访缘由，她想起半年前裕哉曾发来这里的照片，其中包括入口与紧急出口。她当时只当普通风景照看过，直到现在才想起来。下午，さやか与花也分房居住。约晚 8 时，さやか取罐头和水回 108 号吃饭。柊一和翔太郎留在食堂修理点火失灵的炉具，矢崎一家在晚 7 时前取餐后便没有出房。约 9 时，柊一和翔太郎看见さやか把一个黑色物件交给花。翔太郎察觉，众人没有采取集中住宿、轮流监视的防凶办法，反而纷纷独居，也许他们潜意识里宁可再发生事件，换来能找出牺牲者的线索。
第三天早晨，花解释昨夜收到的黑色物件是绝缘胶带。さやか在房里摔碎水杯，从二层取胶带清理碎屑，花顺便借来粘衣物毛球。晚上 9:30，花还看见さやか四处找东西。如今 108 号却空了，人和背包一起消失。八人结队搜索，在二层 206 号找到无头女尸。衣着、体格、缺席者都表明，死者是さやか。翔太郎发现颈根残留勒痕，胸部虽有刺伤，出血却少，判断她先被勒死，再被刺胸断头。这里上方靠近发电机，锯切声很容易被盖住。垃圾桶内留着沾血围裙、长手套、长靴，都是方舟内原有物品。靴跟夹着沾血纸片，翔太郎认出是 118 号的工业纸擦拭布。头、绳索、凶器都不见了，可能已被抛入三层积水。
众人检查了所有人的行李，一无所获。108 号却留有夹着玻璃屑的黑胶带，支持花的证词。花、麻衣、隆平都见过死者找东西，最晚一次约 10 时。118 号少了一包纸布，盛放纸布的篮子留在地上，没有放回高架。凶手似乎怕放回篮子时发出响声，惊动附近住户。然而二层 207 号工具库里，刀锯旁明明就有抹布。大家找扳手时都整理过那里，不可能完全不知道。既然只是擦血，为何非要冒险上楼取纸？这比行李检查更值得追问。柊一和翔太郎把尸体移到一层。下午 2:32，二层开始进水，与先前估算相符。花看着地面监控，暗盼矢崎父母会为儿子自愿留下。幸太郎终于承认，采蘑菇是谎话。弘子的弟弟陽二加入宗教后失踪，一家从他的日记找到“方舟”的名称和位置，想来查线索，途中迷了路。麻衣反复确认他们事先知道多少，是否见过照片。幸太郎说日记没有照片，他们对地景并不熟悉。
当夜，翔太郎私下把断头与失物联系起来。身份调包在封闭空间里不现实，收藏头颅也无处藏放。切头既费时又危险，必须有迫切用途。他判断，さやか寻找的是手机，里面可能存着她自己尚未察觉的重要证据。柊一确认さやか平时使用面部识别。按翔太郎的推演，凶手勒死她后才发现她没带手机。若别人先找到手机，就可能用尸体的脸解锁。因此凶手切走头，又取走全部行李，掩盖“唯独手机不见了”这一事实。两人尚不知道数据内容，只猜它与裕哉案有关。翔太郎考虑潜水取头，提出改造裕哉的背包，用绳索或胶管固定气瓶，做成背具。柊一与社团旧友都有潜水证，但水温冰冷，残气有限，三层障碍众多，风险太大。两人决定先找手机，却都未找到。
第四天，矢崎一家用铝管接成长竿，想从门外转动卷扬机，最终失败。麻衣和柊一涉水去看时，柊一举着手机照明，麻衣靠近他同行。回到楼梯上，麻衣问，把杀人者留下送死，其他人是否也成了杀人者？她反对按有无家人、被多少人爱来决定谁该牺牲。两人在绝境中亲吻，她说无论如何都想活着回去。
翔太郎找到了手机。它放在 215 号深蓝电工箱的盖上，手机套恰好也是深蓝色，连主人和昨夜搜索的柊一都漏看了。手机与箱盖接触处留有辣豆肉酱污迹，似乎さやか晚餐后取胶带时，就把手机放在了那里。手机已经半浸水，按键没有反应。翔太郎却说，比数据更重要的是发现手机的位置。他把位置告诉众人，给他们看了现场照片。
第五天夜里，翔太郎已能缩小嫌疑范围，却缺决定性证据。他以为众人的警戒与积水会阻止凶手再次作案，便让柊一先睡。
第六天 2:32，隼斗的惨叫惊醒柊一。二层积水已约 70 厘米，幸太郎死在 207 号钢架底层，胸口被刺，附近沉着接有调节器的气瓶和长柄修枝剪。据弘子说明，幸太郎此前在棚板背面发现血刀，猜凶手会取回，便从晚 7 时左右开始埋伏。他打算听见有人下楼后，抱着气瓶潜入棚下，拍下对方拿刀的过程。他没有穿涉水裤，免得别人发现楼梯上的裤子不见了，察觉他在二层。他 7 小时后还没回来，母子才去寻找。血刀仍在原处。翔太郎和柊一挪开钢架，找出幸太郎落在架底的手机，还能开机，却无人知道密码。翔太郎判断，这是意外相遇后的突发杀人。凶手穿涉水裤避免湿身，既不愿费时搬架，弄出响声，也不能俯身潜入水中捞手机，否则全身湿透后便会暴露。回楼梯时，翔太郎提起脱下的涉水裤，接住险些掉入水里的裕哉的指甲剪和透明拉链小袋。任何人都能趁两人外出时进入 112 号拿走东西。刀没取走，指甲剪却已与小袋分开，其用途仍不明。弘子坚持带丈夫尸体回房，由她和儿子尝试解锁手机。翔太郎没有强逼。翔太郎私下分析，清白者遇见水下藏人，应会怕对方是凶手而呼救，此人却立即动手杀人，更像是有秘密。第二案又是为了隐藏与第一案有关的数据，三案因此应出自同一凶手。
さやか的手机干燥后仍无法启动。数据线索似乎走到尽头。只剩 24 小时，柊一听见弘子告诉儿子，如果无法解锁，她就留下落石，让他回家。隼斗哭着说宁愿一起死。母子屡次尝试指尖识别，都没有成功。众人反复看监控，地面始终没有变化，期限却在逼近。只剩 14 小时左右，隆平闯入矢崎一家的房间，夺过手机，把尸体十指逐一按在传感器上。隼斗拿铝管打他，也误伤前来阻拦的柊一。翔太郎警告，受伤后可能无法转动卷扬机，喝止了争斗。麻衣提出，幸太郎也许登记的是关节附近皮肤，以便手指脏时使用。弘子试了右拇指关节下方，终于解锁。录像记录的是前夜 10:48，最初黑暗中出现一点白光，随后荧光灯亮起，穿涉水裤的人走向棚架，停顿后拿来修枝剪，冲向镜头。画面翻转，留下气泡，始终没有拍到脸。翔太郎说，影片本身不足以认人，却让他的推论更有把握。
地下建筑的孤岛模式，从两处细节推理用排除法推凶手，切入点简单巧妙。作品让求生欲不断干扰人物的判断，也让信任与感情成为绝境中的难题。最大的亮点是结尾的动机逆转，看得出作者写冒险小说构造意外性的功力。