主人公半田理久在朋友堤宗太的提议下回到即将拆除的高中旧校舍，寻找当年布置的符咒，路上遇到早坂紗季。三人在储物间内发现一具穿着宇航服的白骨尸体，宇航服上有“イースト・ラネル”的公司标志。三人给尸体起名为 Charlie，为了检验骨头成分，编了一套狗骨头的谎话，从科学老师佐竹学那里借出了高倍显微镜，确认骨头不是伪造。佐竹要求看狗的照片，三人只好请伪造艺术家筧華乃子伪造照片，并同意她加入侦探团队。華乃子在宇航服胸口的口袋中发现一个笔记本，上面用日语写着“ELISA 计划”和一系列高中生活记录，还有一些密码文。紗季的姐姐千穂四年前死于一场陨石坠落引发的交通事故，華乃子加入团队是为了与紗季重归于好。

侦探团来到“イースト・ラネル”工厂，却得知周末不开门。一名叫加藤的员工听到众人对话，主动提供线索说工厂从未生产过宇航服。華乃子把笔记本里面的密码文发布在网上，有网友成功解读，但译文中包括 Enlaced Inner Space Archiver 等难以理解的内容，ELISA 代表未来生成虚拟现实的超技术。理久在校门口遇到一名可疑女子。加藤给学校打电话留言，让理久等人关注一部名为《阴影坠落》的电影，里面出场的科学家穿着和 Charlie 一样的宇航服。电影结束后屏幕上推荐了一部相关电影，主演接知彩花就是理久在校门口看到的可疑女子。大家推测彩花在网上看到了密码文，所以才会来到校区。華乃子主动联系彩花，彩花与侦探团见面。

彩花当年与新人演员本条絵里奈合作出演了一部电影，不久后絵里奈因血液疾病去世。絵里奈临终前写了一部剧本，讲述一家邪恶企业开发了一种名为 ELISA 的虚拟现实生成技术，可以连接人们的记忆，类似于《黑客帝国》。故事的主人公是一群宇航员，计划逃离虚拟世界，摧毁母计算机，但故事没有写完便提前终止。彩花惊讶地发现旧校舍的宇航员白骨与故事结尾完美契合，密码也和彩花找专业美术人员设计得一样。众人推测因为剧本在云端共享，所以肯定有别人登录了絵里奈的账户，读到了彩花续写的剧本。侦探团查到絵里奈的遗物中有一台笔记本电脑，她的男朋友伊藤隼人曾经猜出了登录密码，随后失踪。

在即将拆除的旧校舍中发现身穿宇航服的白骨尸体。谜面惊人，解答拉垮。