故事分两部分叙述，上部为2001年，下部为2016年。
【2001年】女子A给教授B当助手，B说自己从2016年乘坐时间机器穿越而来。B接到神秘男子C电话要求会面，二人会面时发生激烈争吵，C持刀欲攻击B，A过去劝架，撞在墙上晕倒。A醒来发现自己和B的尸体一起反锁在房间里。B左胁中刀而亡，不知为何临死前没有求救。警方接到匿名电话后赶到现场。
死去的B其实是研究员C冒名。凶器刀把上验出A的五个指纹，但握法是倒握。真正的B与未婚妻D订婚，现场的刀和粘土上均验出B的指纹，因此B也有嫌疑。B提出自己有不在场证明，案发时B正在参加某派对，分别在七点、八点、九点和检察官的女儿E拍了三张照片，照片上有E的手表指针指示时间。E的手表浑然一体，无法人为调整时间。律师发现第二张照片中E的衣服上染上绿色污渍，第三张却没有污渍，并由此揭露E的诡计。
时间诡计
B与E拍完第一张7:00的照片之后，将E的手表背面贴上重物，使表盘发生转动，变成9:10（同为150度），拍下假冒的第三张照片。B行凶后于9:05赶回派对，拍下假冒的第二张照片冒充8:00。
检察官提出新证物安眠药瓶，瓶内外侧均检测出A的指纹。法院休庭。A从单人牢房中消失。瓶子的指纹里检测出一种化学成分，与A在案发后得到的护肤品的化学成分相同，证明检察官故意设套让A在开庭后接触瓶子。
【2016年】A从仓库醒来发现自己穿越到2016。B的妻子D四年前去世。十五年前B告诉A，有人预定在2016年谋害自己。警察凌晨五点接到匿名电话，在第一实验室发现F的尸体，与晕倒的A一起反锁在密室中，警察将门闩撞断才得以进入室内。B失踪，时间机器的记录媒质亦不知去向。A说B十五年前将自己封入冷冻胶囊，A苏醒后F按照B的指示将冷冻胶囊从仓库搬到实验室，导致实验室温度下降，A右脚冻伤。
密室诡计
现场照片里门闩断口结霜，说明门闩是事先折断安放在现场。凶手在门上浇水，室内温度下降后结冰将门冻住。
验尸表明死者不是F而是B。原来真正的B以F的名义加入研究所，而A认识的B其实是十五年前死去的C假冒！C在法庭现身，说自己从十五年前穿越而来。
穿越真相
法庭上的C其实是C的外甥G，G按照C的指示等到2016年时间机器的计算邻近完成，盗走时间机器，并将冷藏的A放出。C在法庭上乘坐时间机器回到过去，见到小时候的C，告诉C说将来他长大以后会发明时间机器，C将穿越来的G当成是长大的自己。C在2001年的密室中左胁中刀却没有呼救，是因为确信自己不会死，长大以后会乘坐时间机器回到过去。
时间跨度十五年的两起密室，都是女主角与被害人反锁在实验室中被警察发现，都有身份混淆梗，具有一定的对称性。逻辑推演中夹杂人体冷冻、时间机器的科幻情节，放到逆转裁判的背景中略感违和。做成游戏可能比小说效果更好。